Система пробоподготовки для работы с транскриптомом единичных клеток ddSEQ™

ddSEQ™ – новый генератор капель производства компании Bio-Rad, позволяющий за 5 минут изолировать единичные клетки для последующего анализа транскриптома каждой отдельной клетки путем секвенирования нового поколения (NGS).

В приборе ddSEQ™ используется специальный картридж, в котором клетки и реагенты для лизиса и баркодирования автоматически соединяются в капле специального масла и изолируются.
Затем капли переносятся в 96-луночный планшет и помещаются в термоциклер, где происходит лизис клеток и обратная транскрипция с баркодированием. Остается только разбить эмульсию и переходить к подготовке библиотек!

С помощью прибора ddSEQ™ вы сможете:

• изолировать 1 000–1 200 клеток в день;
• обработать до четырех образцов за 5 минут;
• быстро и качественно подготовить клетки к NGS-секвенированию.

Секвенирование РНК единичных клеток помогает в изучении функции клеток, развития заболеваний и определении терапевтических таргетов. С помощью изучения сотен и тысяч единичных клеток ученые могут разделять индивидуальные клетки в гетерогенной популяции.

Технология секвенирования единичных клеток позволит вам:

• обрабатывать от сотни до десятков тысяч клеток за один день;
• характеризовать транскрипцию с большой чувствительностью;
• изучать клетки вне зависимости от их размера.

Принцип изоляции клеток:

Реакционной площадкой служит специальный картридж (8 х 3 лунки).
Одновременно картридж вмещает до 4 образцов.
В крайний нижний ряд помещается масло, в средний – через лунку образец с клетками и реагенты для лизиса и баркодирования клеток.

С использованием особых микрофлюидных технологий в ходе работы прибора формируются микроскопические капли масла (<1 нл), в каждую из которых попадает одна клетка и реагенты для лизиса и баркодирования.

Области применения:

• клеточная дифференциация;
• репрограммирование клетки;
• характеристика клеточных субпопуляций;
• изучение гетерогенности опухолей.