EU (5-этинил уридин). Арт. 2439-500mg

Метаболическое мечение ДНК модифицированными алкинсодержащими уридинами, такими как 5-этинилуридин, бром-уридин (BrU), фтор-уридин (FU) и 4-тиуридин (4sU), позволяет проводить оценку транскрипции РНК in vitro и in vivo.
Полученная функционализированная РНК может быть впоследствии обнаружена с помощью клик-химии. Процесс основан на азид-алкиновом циклоприсоединении, катализируемом медью (I) (CuAAC) с возможностью выбора введения группы биотина (через азиды биотина) для последующих задач очистки или флуоресцентной группы (через азиды флуоресцентных красителей) для последующего микроскопического исследования.
5-этинилуридин (EU) – широко используемый в молекулярной биологии реагент для изучения и оценки синтеза РНК. EU свободно проникает в клетки и фосфорилируется киназами в рамках дополнительного пути синтеза пиримидиновых нуклеотидов. Образовавшийся 5-этинилуридин-5’-трифосфат с помощью РНК-полимераз I, II, III встраивается в образующуюся de novo РНК вместо уридина. Алкинильная группа реагирует с азидами флуоресцентных красителей или биотина, что позволяет оценить уровень транскрипции в клетке различными методами, например, с использованием флуоресцентной микроскопии или проточной цитометрии.
Кроме этого, в экспериментах in vivo EU имеет преимущество перед аналогами, например, 5-бромоуридином, поскольку азиды флуоресцентных красителей обладают гораздо лучшей проникающей способностью в ткани по сравнению с антителами, которые используются для детекции BrU. Это позволяет использовать EU для анализа крупные образцы тканей и органов и окрашивать их целиком.
Исследования цитотоксического эффекта модифицированных уридинов свидетельствуют об их способности негативно влиять на РНК при продолжительном воздействии или дозозависимым образом. Токсические механизмы включают нарушения сплайсинга и псевдоуридинилирования, изменение стабильности модифицированных РНК.

Отличительной особенностью EU является низкий уровень токсичности, отсутствие выраженного влияния на транскрипцию и процессинг мРНК. Данный реагент вызывает медленное снижение жизнеспособности клеток в высоких дозах, поэтому может быть использован для мониторинга динамики транскрипции, оценки изменений в синтезе РНК после повреждения или изменений в экспрессии РНК после, например, медикаментозного лечения.
Кроме того, EU успешно используется в неинвазивных пролонгированных исследованиях реакций растительных организмов на абиотический стресс, что, в том числе, выражается в синтезе РНК с низкой стабильностью. Данный метод в сочетании с секвенированием РНК, был применен для изучения стабильности ядерных и хлоропластных РНК, роли специфических путей деградации и стабилизации цитозольной и пластидной РНК в определенных стрессовых условиях.

Технические характеристики:

• Молекулярная формула: C₁₁H₁₂N₂O₆
• Молекулярная масса: 268.22
• Растворимость: вода, ДМСО, ДМФ
• Контроль качества: ЯМР 1H, ВЭЖХ-МС (95%)